東莞勞務派遣用工在拓寬就業渠道，緩解就業矛盾，保護勞動者合法權益等方面發揮了積極的作用，對農民增收、經濟能培訓等方面取到良好的效果，但是勞務派遣用工制度還存在著一些隱患亟待解決。
    東莞勞務派遣用工制度的弊端：
    從勞務人員看，由于勞務派遣是招聘與用人相分離，即勞務派遣機構"招人不用人"，而用工單位"用人不招人"。被派遣到用工單位的勞務人員缺乏歸屬感，容易出現責任心不強、缺乏長遠打算問題。部分勞務人員與用工單位職工一起工作時，存在的同工不同酬現象，也容易影響工作積極性。
    從用工單位看，由于用工單位的人員需求不同行業、職業種類繁多，給勞務派遣機構在用工選拔、培訓和管理方面造成一定的困難，員工素質難以保證。有些單位為了降低用工成本，把單位內部長期固定的正常勞動崗位，轉為"勞務派遣"崗位。用人單位與勞務公司合作，勞動者還是那些勞動者，卻被轉變為由勞務公司派遣，使勞動者收入大幅降低，損害了勞動者的利益。
    從東莞勞務派遣機構看，勞務派遣機構參差不齊，個別勞務派遣機構存在組織不規范、人員素質低，濫用勞動力派遣等現象；由于《勞動合同法》規定勞務派遣公司注冊資本不得低于法定最低限額，個別經濟實力弱的公司存在注冊資本虛假出資、撤資問題；在產生勞務糾紛時，勞務派遣機構作為勞動合同法的履行者很難保證其公平與公證，勞務人員的合法權益無法得到有效保障。